資料探勘第四次作業

In: Computers and Technology

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Words 1580
Pages 7
國立雲林科技大學
資訊管理研究所

資料探勘第四次作業

組 長:王智文 M10123033
組 員:林 璂 M10123017 羅煒業 M10123038 彭浩政 M10123058

中華民國一百二年一月

摘要

蛋白質是生命的第一要素,是構成細胞與肌肉組織不可或缺的物品,通常這些都是以不同形式參與維持生命的重要化學反應。而生命中還是有兩萬多種酵素,也是由體內二十多種氨基酸以不同的排列組合而成,然而酵母的主要成分也是都由蛋白質所組成,且酵母可分為(一)麵包酵母、(二)食品酵母、(三)藥用酵母、(四)飼料酵母,其應用也很廣泛。也讓本組認識蛋白質分類的動力。想要藉此來讓相關研究人員方便做實驗用。本次實驗主要是以Matlab來進行實驗,資料集為區域性的蛋白質酵母(yeast)實驗。使用了K-means分群演算法,經由調整其分群參數後,以產生的分群結果其SSE與平均群間距離來做比較,並計算分群品質以做為評估,同時產生K=1至K=40的平均SSE、平均群間距離與分群品質的趨勢圖,並以其中有代表性的K值產生之分群結果來觀察分群的示意圖,以此來做為結論的依據。而依據實驗結果,得出在K=5與K=14時,平均群間距離與分群品值有較強烈的成長,可以判斷K=5與K=14是較佳的分群結果。最後將K=5與K=14使用分群示意圖及原始資料數據比對,基於yeast資料集的類別屬性有10種,所以對yeast資料集進行K-mean演算時,其K值至少要大於10,因此K=14應為最佳之分群結果。

關鍵字:蛋白質、酵母、資料探勘、Matlab

目錄
摘要 i
一、緒論 1
1.1 動機 1
1.2 目的 1
二、背景知識 2
2.1 Matlab簡介 2
2.1.1 Matlab的介紹 2
2.1.2 Matlab的歷史 2
2.1.3 Matlab的特性 3
2.2 K-means演算法 3
三、方法 5
3.1 實作說明 5
3.2 關鍵程式碼 7
四、實驗 9
4.1 資料集 9
4.2 前置處理 11
4.3 實驗設計 11
4.4 實驗結果 12
五、結論 16
附錄A:遭遇的問題及解決方法 16
附錄B:心得 16
參考文獻 17

一、緒論
1.1 動機
現在我們吃的以及用的東西已經有很多是屬於酵母所發酵產生的食物,凡舉麵包、醬油、酒類、優酪乳、農業、藥物、動物的飼料等等。酵母菌不論是人工或是自然產生的,都於我們的日常生活當中隨處可見。
酵母來自於天然的營養和營養載體,其營養成分具有“三低四優”的特點,即低脂、低糖、不含膽固醇,富含優質完全蛋白質、完整的B群維生素、以生命結合態形式存在的多種礦物質和功能膳食纖維。且酵母中含有豐富的蛋白質,高達40%~60%,營養價值高。也因為酵母的營養價值高,同時人體對酵母的消化率也將近達100%,酵母有如此多的優點,因而使得我們也想進一步了解有依據多種不同酵母的特性的影響,應當被列屬於哪一種蛋白質。

1.2 目的
本次研究主要目的是熟悉Matlab的操作與程式的撰寫,同時希望能夠提供相關的研究知識以協助相關生物相關研究人員做進一步的了解,其中實驗的部份將採用K-means分群演算方式來進行,並用不同的參數及分析方式來找出資料中所隱藏的資訊與關係。

二、背景知識
2.1 Matlab簡介

2.1.1 Matlab的介紹
Matlab是一種數學軟體,其名稱是由「矩陣實驗室」(Matrix Laboratory)所合成的,故可知其最早的開發目的的是針對矩陣方面做運算,其提供高階數學運算能力與進階的繪圖工具,可幫助使用者完成資料分析、資料視覺化、以及演算法與應用程式的設計等目的,如今隨著矩陣的應用愈加發達,Matlab也愈受歡迎,目前世界上100多個國家的超過一百萬工程師和科學家在使用Matlab。

2.1.2 Matlab的歷史
最早第一個版本的Matlab,是在1970年代末到80年代初時,由美國新墨西哥大學(University of New Mexico)教授的克里夫•莫勒爾(Cleve Moler)獨立用FORTRAN所編寫,起因是當時的學生並無透過FORTRAN編寫相關經驗,為了減輕學生的負擔,可以更方便地使用LINPACK及EISPACK,故才因此寫了Matlab。而這時的Matlab版本還未推向市場,克里夫•莫勒爾(Cleve…...

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北京机动车限牌政策必要性探究

... 北京机动车限牌政策必要性探究 2011年4月19日 前言: 2010年12月23日,北京市政府正式对外公布了《北京市小客车数量调控暂行规定》,确定2011年度小客车总量额度指标为24万个,俗称“限牌令”。该规定一经面世,引起了社会上大量的争论,许多市民尤其是网民对其提出了强烈质疑。那么究竟北京实施“限牌令”有没有必要呢,下面我将利用资料、数据结合本课所学知识对北京机动车限牌政策必要性进行探究 一、“限牌令”简介 即《北京市小客车数量调控暂行规定》,通过限制申请牌照的方式控制2011年度新增小客车不超过24万个,民间称呼“摇号”、“限牌令”等。 2011年1月进行的第一次摇号中,共有近20万人提出申请,中签率10.6%,2月进行的第二次摇号中,竟有30万人参加摇号,中签率仅5.7% 。3月则有近40万人参加摇号,中签率更是降至4.4% . 因其较强的限制力度、极低的中签率,“限牌令”在社会引起强烈反响,普通未购车的民众对“限牌令”异议甚多,甚至部分专家也对“限牌令”提出了质疑。全国乘用车信息联席会秘书长饶达指出不排除部分摇到号的人有偿转让“牌照指标”给有购车需求的人,从中牟利。汽车营销专家张志勇则表示“摇号限牌”只能起到缓解作用,要使北京交通目前的拥堵状况得到彻底治理,更趋科学化的市政规划和方便快捷的公交系统,才是治本之策。 二、北京交通发展状况分析 为更好地分析北京实施“限牌令”的必要性,我们先对北京交通发展状况进行分析,主要从四个方面进行讨论。 1、 北京市常住人口 北京市统计局发布的数据显示,截至2009年末,全市常住人口1755万人。 而“十一五”规划末要求,北京常住人口的控制目标为1625万人。 且北京市常住人口的增长速率十分惊人,从国家统计局网站上找到的一组数据如下 年份 | 2000 | 2001 | 2002 | 2003 | 2004 | 2005 | 2006 | 2007 | 2008 | 2009 | 常住人口(万人) | 1363.6 | 1385.1 | 1423.2 | 1456.4 | 1492.7 | 1538.0 | 1581.0 | 1633.0 | 1695.0 | 1755.0 | 更有北京市人大常委会通过专题调研掌握的数据显示,截至2009年底,北京实际常住人口总数为1972万人,已超过国务院要求的到2020年,北京总人口规模规划控制在1800万人左右的目标。 2、 北京市机动车保有量 从北京市公安局公安交通管理局的网站上找到的数据如下 年份 | 机动车保有量(万辆) | 2003 | 212.4 | 2004 | 229.6 | 2005 | 258.3 | 2006 | 287.6 | 2007 | 312.8 | 2008 | 350.4 | 2009 | 401.9 | 2010 | 478 | 由数据及折线图可以看出近年北京市机动车保有量以一个较高的增长率增长。那么究竟增长速度有多快呢? 给出两个形象的说法:第一,1997年,北京机动车突破第一个100万,2003年8月,机动车突破200万;用6年时间翻了一番,2009年12月份下旬达到400万辆,时隔6年又翻了一番,近似呈指数增长; 第二,北京机动车保有量从300万辆到400万辆,仅用了2年7个月,东京实现这一变化却用了12年的时间。......

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Cobalt

... |服務機關:台灣中油公司石化事業部 | | |職務:運籌室業務管理師 | | |姓名:陳日上 | |出國地點: |美國 | |出國期間: |96 年8月01日至97 年1月31日 | |報告日期: |97年4月08日 | 目 錄 壹、前言......................................3 貳、研習計劃時程..............................3 参、研習課程內容記要..........................4 肆、實習訓練心得..............................42 伍、研習心得與建議事項........................45 1. 前言 本公司積極謀求產銷輸儲之統籌,以擴展國際業務,於93年先於石化事業部成立運籌室,目前除了引進新人外,亦積極提升現職人員的相關國貿能力。94年底將石油腦採購業務輪換至運籌室承辦,由於原料成本,佔本公司的成本高達80%以上,因此採購價格相當重要,故訓練採購人員熟悉相關採購談判技巧為此次研習重點,且相關規定,石油腦採購人員,應受相當專業商業知識訓練,職亦藉此進修增進石油腦採購專業知識。 2. 研習計劃時程說明 本培訓計劃執行時間始於 96年8月01日終於97年1月31日合計6個月。 (一)、第一階段8/03-8/31,合計一個月,研習地點為 University Of California – Extension,CA,USA,主要課程內容如下: 1.商業專業英語名詞研習。 2.美國重要公司的興衰史介紹。 (二)、第二階段 9/18-12/10 研習地點為 University Of California – Extension,CA,USA,主要課程內容如下: 1.(9/18-9/24)ACP(Accerlated Certificate Program)課程介紹。 2.(9/25-10/08) 國際商業策略與結構(International Business: Strategy and Structure)。 3.(10/09-10/16) 國際商業財務(International......

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企業評價

...企業評價與績效評估 目錄 * 企業評價之沿革………………………………………………………………..……..………..…..2 二. 企業評價之趨勢…………….………………………………………………………………………2 三. 何謂企業評價…………………………………………………………………….………………….3 四. 何謂價值…………………………………………………………………………….……………..….3 五. 評價時必須了解的問題...............................................................................................4 1.評價標的為何………………………………………………………………..……..……………..4 2.評價目的為何…………………………………………………………………..……..…………..4 3.價值標準為何………………………………………………………………..………..…………..4 4.價值前提為何………………………………………………………………..………..……....…..5 5.價值標的的風險因素為何…………………………………………………………..………...6 6.關鍵價值驅動因子-價值來源之探索……………………………………….…………..…6 六. 評價方法………………………………………………………………..……..…………...…………7 1.資產基礎法………………………………………………………………..…………..….………..7 2.市場法………………………………………………………………..……..……………..….……..7 3.收益法………………………………………………………………..……………….….…………..8 七.學習心得………………………………………………………………..……..…………..…..………..9 八.資料來源………………………………………………………………..……..………...…….………..9 * 企業評價之沿革 1920年依據美國憲法之第18次修正案規定,美國聯邦政府禁止酒精飲料行業,於是開始了美國的禁酒時期,這段期間內,有關的企業被迫結束這些酒精飲料業務,為進行合理徵收,便涉及企業評價的問題,這就是企業評價的起源。當美國政府開始徵收酒精飲料行業的設備時引發了爭議,同樣的設備以同樣的價格徵收有人認為不盡公平,因為同樣的設備營利可能有數倍的差異,因此又衍生了品牌,無形資產等的概念。 這些概念的產生才能使交易合理。 為了合理交易必須要有專業的人士來執行,因此又衍生了[企業評價]的理論與技術,由受過訓練的專業人士來進行評估才合理,因此有了合理的評估,使得買賣雙方有一個客觀的標準而使買賣更合理公平,買賣雙方能更快的進行交易,這就是企業評價的歷史與發展。 * 企業評價之趨勢 在21世紀初期,一些關鍵的因素使得評價的需求增加茲說明如下: * 公司治理因素 自從恩隆案發生之後,企業利用財務報表虛構盈餘從投資人手中騙取大量的金錢行為層出不窮,國內如博達、勁永、太電、皇統,數碼細胞等熟稔財務操作的有心份子利用財務報表詐財,使得分析企業內在真實價值的[企業鑑價],再度成為企業價值判斷的重要依據,從四大會計師事務所到投資銀行如高盛、美林、摩根以及大型企管顧問公...

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資深工人註冊工作年資證明書須知

...資深建造業工人註冊 填寫工作年資證明書須知 填寫申請資深建造業工人註冊工作年資證明書須知 甲. 資深工人註冊類別及要求 註冊類別☆ (a) * (b) # 申請註冊資格 第一類 申請人尚未持有申請為註冊熟練技工(指定工種分項) 的資格,包括持有條例內附表1所指由建造業議會 (議會)或職業訓練局(職訓局)所頒發的技能測試證書 或其他指明的認可資格(例如其他認可的註冊、證書 或牌照等),但能證明於2015年4月1日前已具備不少 於10年親自進行相關工種分項的工作經驗,其中不 少於6年在2005年12月29日前取得。 第二類 申請人尚未持有申請為註冊熟練技工(指定工種分項) 的資格,包括持有條例內附表1所指由建造業議會 (議會)或職業訓練局(職訓局)所頒發的技能測試證書 或其他指明的認可資格(例如其他認可的註冊、證書 或牌照等),但能證明於2015年4月1日前已具備不少 於10年親自進行相關工種分項的工作經驗。 備註: ☆ 如指定工種分項在附表1 “其他資格或要求”內列出有關的資格,則此工種分項不設資深 建造業工人註冊。 * 第一類的資深工人可以合資格註冊成為相關工種分項的註冊熟練技工。如申請人曾經註冊 為相關工種分項的註冊熟練技工(臨時),將會視為於2005年12月29日前具有6年相關工作經 驗的一項證明。 # 第二類的資深工人必須通過評核,才可以合資格註冊成為相關工種分項的註冊熟練技工。 如申請人曾經註冊為相關工種分項的註冊半熟練技工(臨時),可視為具有2年相關工作經驗的 一項證明。 乙. 申請資深工人註冊 相關工種分項工作年資證明:申請人須填寫及提交「申請資深建造業工人註冊工作年資證明 書」,以證明申請人具有所需親自進行有關工種分項的工作年資。 截止申請日期:2016年9月30日。 頁1 / 共10頁 丙. 填寫「申請資深建造業工人註冊工作年資證明書」指引 1. 申請人須詳細填寫「第一部份:親自進行指定工種分項的有關建造工作的詳情」,及盡可 能填寫表一內的項目詳情,申請人並須簽署「申請人聲明」部份。 2. 申請人可選擇以下其中一個途徑就第一部份表一內的工作年資提供證明,並遞交申請予註 冊主任考慮: 工會證明 - 申請人將表格SWR1、表格SWR2(如適用)及一切有關的 工作證明資料或文件予工會,並由工會按建造業工人註 冊委員會的指引、原則及既定程序審核其工作年資,並 在第三部份作出確認。 直接遞交工作年 資證明予註冊主 任 - 申請人將表格SWR1、表格SWR2(如適用)及一切有關 的工作證明資料或文件直接遞交予註冊主任考慮。 3. 各種工作年資證明的時限 工人的僱主證明* 工會證明 法定聲明 (宣誓) 註冊熟練/ 半熟練技工(臨時) (填寫第二部份) (填寫表格SWR2 及在民政事務 署、太平紳士或 律師面前作法定 聲明(宣誓)) (現時 / 曾經註冊為 (一切有關工作 相關工種分項的註 證明資料或文 冊熟練/半熟練技 件) 工(臨時) ) 證明不多於3年 的工作年資(包括 但不限於2005年 12月29日之前的 工作年資) 相關工種分項的註 冊熟練技工(臨時) 證明 ,將會視為於 於 2005 年 12 月 29 日 之 前 6 年的 工......

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Elearning

...大 學 資訊與社會研究所 碩 士 論 文 以整合性科技接受模式探究 哈客網路學院數位學習之研究 The Study of Using UTAUT to Explore the Hakka E-learning Systems 研 究 生:歐淑芬 撰 指導教授:晁瑞明 教授 中華民國九十九年一月 本論文獲行政院客家委員會 99年度客家研究優良博碩士論文獎助 ii 行政院客家委員會獎助客家研究優良博碩士論文精要 一、論文名稱:以整合性科技接受模式探究哈客網路學院數位學習 之研究 二、作者:歐淑芬 三、獎助年度:99年度 四、獎助金額:新台幣伍萬元整 五、研究過程(含研究方法、研究對象、研究工具等) 本研究以 Venkatesh (2003)所發展出的整合型科技接受模式 (Unified Theory of Acceptance and Use of Technology, UTAUT) 中結合神迷經驗(Flow Experience)的構面,來探討哈客網路學院 數位學習的使用作成效;依據文獻蒐集與分析,本研究所謂「科技 的接受度」係指「使用意願」(BI)和「使用行為」(Usage)的強度。 「外部變數」由 UTAUT 中的四個主要構面導入神迷經驗所組成,調 節變數方面以性別(Gender)、年齡(Age),來觀察採用因素對使用 意願的差異。 本研究分為二部分,第一部份說明績效期望、努力期望、社會 影響、促成因素與神迷經驗五個構面與數位學習的使用意圖;第二 部分說明性別與年齡兩個調節變數對哈客網路學院的採用因素之 關係。 i 神迷經驗 Flow Expectancy 使用哈客網路學院意願 績效期望 Performance Expectancy 實際使用哈客 網路學院的行為 努力期望 Effort Expectancy 社會影響 Social Influence 調節變數 moderators 促成因素 Facilitating Conditions 性別 年齡 本研究架構圖 本研究將研究對象鎖定為已具有「哈客網路學院」使用經驗者 為研究對象,透過與哈客網路學院相關的討論區、電子佈告欄進行 問卷訊息的發送,以此接觸目標對象,進行網路問卷填寫蒐集,做 為後續統計分析之資料。本研究問卷分為兩部份:第一部份人口變 項資料問卷,主要了解受試者個人資料、調節變項及哈客網路學院 數位學習的使用行為。第二部分,影響使用者採用哈客網路學院數 位學習因素之衡量,構面量表的計分方式皆採 Likert 五點量表, 從非常不同意到非常同意採雙極計分,等距尺度量測。 六、主要研究發現 影響使用者採用哈客網路學院數位學習的行為意願及使用行 為藉由文獻探討得知,可概分為績效期望、努力期望、社會影響、 促成條件、神迷經驗等五大部份,其中績效期望包括:知覺有用、 工作相關、預期成效等三項;努力期望包括:知覺易用、複雜性、 操作簡單等三項;社會影響包括:社會因素、主觀規範、公眾形象 等三項;促成條件包括:支援系統及自我認知等二項;神迷經驗包 括:專注、愉悅、好奇三項等;而行為意願與促成條件影響使用行 為。 本研究結果藉由研究假說逐一說明如下: 績效期望因素會影響使用者對哈客網路學院數位學習的使用 意願,獲得支持:哈客網路學院數位學習的績效期望會直接影響使 用者採用意願,此即表示使用者認為哈客網路學院可以協助其更有......

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Copyright

...我們與著作權 授課教師: 陳顯武 教授 報告學生: (電機三)林佑璟, (心理四)林蕙潔, (心理一)蔡曉風 (心理一)施佑瑩, (生科四)黃繼展, (外文四)劉翰庭 1. 前言 在今日各類書籍充斥市面的時代,大眾往往為了擷取各類書中的部分資訊,而花些小錢藉由影印來獲得所需.這些現象在大學生中尤其普遍,也引起不少爭議和話題,這些行為是否合法,更成為一項十分值得探討的課題.我們對此產生濃厚的興趣,並做了一項調查,專為這些現象做些基本的動機探討和整理歸納,結果如下: 非常不符合 1 不符合 2 普通符合 3 符合 4 非常符合 5 1.我會擷取網路上不同文章 的一部份,拼湊成自己的報告 2.我對於著作權法在「影印書 籍」的相關規定有所瞭解 3.我對於BBS上轉錄文章在 著作權法上相關規定有所瞭解 由以上結果可知,大多數的學生有過擷取網路上資訊的經驗,而真正了解相關法律規則的卻在人數的一半以下.實際上,這些法律規則條文與我們生活實在息息相關,了解著作權法的基本規定,是每一位民眾應具備的基本知識. 2. 實例與實務 日常生活中,我們最常碰到的問題,舉例如下: 1.我拿原文書去影印犯不犯法?要印多少才不犯法?如果原文書國內書店遍尋都找不到,而且也沒有代理。而我因為研究學習用途需要長期使用 這本書,圖書館也不能長期借書,那在這個情況下我可不可拿去印? 2.BBS上的文章受法律保護嗎?隨便轉錄只是被罵還是原作者 可以告我呢? 3.別人不經過我的同意拿我的報告去印可以告他嗎? 4.我把網路上不同的文章各自剪下拼湊成自己的報告,在法律上 的限制是什麼? 5.老師在學校授課時,常常會因為教學的需要而影印他人的書籍、 文章,或利用他人的文章、圖片來製作教學教材,這些行為在法律 上的限制又是什麼? 以上提及是常見的一些問題,下面會一一探討解答,並舉出一些實際例證. 大學生很常碰到在著作權方面的問題即是,如果今天有一本書國內書店遍尋都找不到,而且也沒有代理。而學生因為研究學習用途需要長期使用這本書,圖書館也不能長期借書,那在這個情況下大多數的人都不清楚自己是否有權力可以拿去印? 其實答案是可以的.在法律方面,供公眾使用之圖書館、博物館、歷史館、科學館、藝術館或其他文教機構,於下列情形之一,得就其收藏之著作重製之︰ 一 應閱覽人供個人研究之要求,重製已公開發表著作之一部分,或期刊 或已公開發表之研討會論文集之單篇著作,每人以一份為限。二 基於保存資料之必要者。三 就絕版或難以購得之著作,應同性質機構之要求者。當然,類似如此般的問題必然還有很多,而根據法律解釋,一切都還是得視情況而定,畢竟合理範圍難以用客觀的方式來訂定一個標準,對於相關合法性,還是得要視情況而定. 基本上,法律條文中有一再強調,只要是合理用途範圍,即不侵權.不過無論如何, 一次印完整本書並不是合理用途範圍,尤其像教科書這般市面上畢竟購買的到的書籍,影印整本基本上是絕對不合法的. 關於 BBS上的文章是否受法律保護.而隨便轉錄原作者可以告轉錄 與否?我想,這樣的案例,比較類似於報紙之新聞報導是否享有著作權? ......

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